行政院秘書長林益世捲入貪瀆風暴，還被特偵組列為被告，今天請辭獲准，林益世認為被指貪污，是場「政治謀殺」，本來林益世還想奮力一搏，在府院黨高層的一場秘密會議裡，林益世羅列人證物證，要求再給一個澄清機會，於是昨天下午第二度召開記者會，這場記者會，府院全程監看，但府方深夜又發聲明，表示應「儘速釐清」，以免「影響團隊形象」，加上陳冲跟林益世懇談，讓林益世不得不求去；為了這場風暴，府方非常罕見，連3天發表用詞強烈的聲明，擔心還有未爆彈，府院決定切割。

行政院秘書長林益世(2012.6.28)：「請辭與否，等到完成這些(澄清提告)動作之後，我相信我會有所決定，跟社會大眾宣布。」

為了解釋沒索賄，林益世連續2天開記者會，本來堅持去留「以後」再說，但一個晚上，急轉直下，林益世發出請辭聲明，重申堅持品格操守，定義這場風暴，是「政治謀殺」。

行政院長陳冲：「我尊重他的選擇，懇談後的結果，他強調他的清白，絕對沒有收賄，但他自我期許很高，所以他不願造成行政團隊任何困擾。」

深夜懇談，林益世決定離開，但在此之前，林益世本還想奮力一搏，平面媒體照片出爐，讓陳冲力挺變切割，把林益世請出行政院會，危機處理。

中午府內一場秘密會議，府院黨高層齊聚，聽林益世報告來龍去脈，當時給林益世2個選擇，一是「儘速決定去留」，一是「再給一次解釋機會」，林益世搬出人證物證，說服高層，再跟外界說明一次，半小時的記者會，府院高層全程監看。林益世(2012.6.28)：「郭先生證明了，我絕對沒有跟他收賄。」

請出地方樁腳、中鋼國會聯絡人跟辦公室主任3大人證，堅強卡司，卻未發揮澄清疑點的效果，深夜府方再發新聞稿，要求儘速處理，以免損害團隊形象，這已經是府方第二度，在林益世記者會後補上一槍，第一次用詞更強烈，強調公務員清廉「不容灰色地帶」，林益世請辭後，府方再度申立場，連續3天連3發，讓林益世不得不求去。

總統馬英九：「不貪財、不怕死、愛國家、愛百姓，言簡意賅。」

跟三軍致詞，總統似乎話中有話，事件發生當天，總統就在中常會後跟林益世見過一面，林益世孤軍奮戰，要來一個解釋機會，但貪瀆風暴踩到馬總統道德底限，一開始，就注定沒有「留下」的機會。